Studia Metodologiczne są czasopismem naukowym poświęconym bardzo szeroko rozumianej problematyce metodologicznej i zagadnieniom związanym z integracją różnych dyscyplin naukowych. Są w nim publikowane artykuły z zakresu ogólnej metodologii nauk, koncentrujące się na analizie wytworów wiedzy naukowej oraz procedur badawczych, stosowanych zarówno w naukach formalnych, przyrodniczych jak i humanistycznych. Łamy czasopisma są również otwarte dla artykułów odnoszących się do nauk, które dopiero kształtują swoje metodologiczne podstawy takich jak: kognitywistyka, nauki medyczne, nauki badające zmiany klimatu czy nauki stosowane. Zgodnie z panującą tendencją Zespół Redakcyjny Studiów Metodologicznych otwarty jest na artykuły zawierające szczegółowe analizy typu case studies, jeśli prowadzą one do ciekawych wniosków o charakterze ogólnym lub są ważne dla uprawiania danej dyscypliny naukowe.